姫路ＹＭＣＡ高等学院は、２００２年４月より姫路ＹＭＣＡにおいて通信制高校「ＹＭＣＡ学院高等学校」の技能連携校として教育活動を展開しています。本学院は、それまでの不登校の子どもたちへのサポートを行っていたフリースクールでのノウハウを生かし、不登校を経験した生徒たちや学校生活になじめなかった生徒たちを中心に、高校を卒業するための学習と高校生活を経験することを目的とした学校です。
　 姫路ＹＭＣＡ高等学院では、連携先の「ＹＭＣA学院高等学校（大阪市）」に同時に入学し、通信課程の学習を全面的にサポートすることで、最終的には通信制高校の卒業を目指しています。現在も、さまざまな問題を抱えた生徒たちが入学し、個別指導やカウンセリングを交えながら、充実した学校生活を続けています。
　 姫路ＹＭＣＡ高等学院は、通信制高校ではなかなか難しいと思われる自宅学習をカバーするために、全日制（毎日昼間に授業を行う課程）の学校として授業を行っています。つまずいた個所からもう一度やり直したい生徒たちや、学校生活を通して友だちを作りたいという生徒たちに、学習の場を提供するとともに、豊かな学校生活を体験できることをねらいとしています。学習能力に問題を抱える生徒たちにも、日々の学習の中で、自分の能力を伸ばしていけるようサポートする一方、人間関係を築くことが苦手な生徒たちには、カウンセラーやスタッフが友だち作りのアドバイスをするなど、それぞれが自己に対して自信を持ち、自立心や社会性を身につけられるよう願っています。

◆週５日制◆
　 週５日制で、時間割も余裕を持って設定され、生徒たちが無理なく学習できるよう配慮しています。
　毎日通学することによって、生活リズムが整い、友だちも作りもスタッフがアシストします。でも、疲れた時は休んでも大丈夫。マイペースで通学するうち、いつの間にか毎日学校に来ています。

◆少人数制◆
　１クラス２０名前後の少人数制で、一人ひとりきめ細かい丁寧な指導をしています。担任・スタッフと講師が連携してクラス運営にあたり、充実した学校生活が送れるようバックアップしていきます。

◆通常授業と補習（選択）授業◆
　不登校を経験した生徒たちにとって、それまでの学習の状況は様々です。通常の単位修得に必要な必修・選択授業では、これまでの学習だけにこだわらず幅広い知識と常識を身につけることができます。
　でも、今までの学習をやり直したいときには、基礎補習授業や自主学習サポートを受講することができます（無料）。また、大学進学を目指している人は、大学受験対策のサポートクラスや小論文添削指導も受講することができます（有料）。

◆個人・保護者面接◆
　生徒個人や保護者に対して、学習や生活面についての面接を行います。生徒たちは、定期または随時に様々な悩みに親身にアドバイスしていきます。保護者へは定期的な保護者面接をとおして、学校での様子を報告するとともに、家庭での様子や問題点を話し合う機会を持ち、日常の生徒指導に活かしていきます。

◆進路指導◆
　個人あるいは三者面接とホームルーム、ガイダンスをとおして、将来を考える機会と情報を提供します。
　大学や短大・専門学校を希望する人には、ＹＭＣＡ学院高等学校による指定校推薦入試をはじめ、ＹＭＣA予備校のノウハウを取り入れた指導を行い、専門学校を希望する生徒には、ＹＭＣA専門学校への特別推薦制度などがあります。
　 また、就職希望の生徒へも、求人情報の提供と就職活動へのサポートを実施しています。

◆学校生活◆
　小・中学時代に不登校であっても、楽しく通学ができるよう、学校に慣れることから始めることによって、生徒本人が無理なく登校できるようサポートしていきます。そのために、随時担任やスタッフに相談できる体制をとっています。また、月２回、カウンセリングルームを開設し、専門のカウンセラーと面接できるよう設定しています（無料）。